ટોમેટો બ્રાઉન રુગોઝ ફ્રૂટ વાયરસ સમગ્ર વિશ્વમાં ટામેટા અને મરીના છોડને ચેપ લગાડે છે, બીજ કંપનીઓ પ્રતિરોધક ટામેટાંના સંવર્ધન પર કામ કરી રહી છે.
ટમેટાના જિનોમિક સિક્વન્સિંગ પ્રોજેક્ટ્સની શરૂઆત પહેલા જ ટમેટાના સંવર્ધકો માટે સમૃદ્ધ આનુવંશિક અને જિનોમિક સંસાધનો ઉપલબ્ધ હતા. ઘણા સ્થળોએ લાંબા સમયથી ટમેટાના જર્મપ્લાઝમના મોટા સંગ્રહની સ્થાપના કરવામાં આવી છે. વિશ્વભરની જીનબેંકમાં 75,000 થી વધુ ટામેટા એક્સેસન્સ સાચવેલ છે. સૌથી મોટી પૈકીની એક જિનીવા, એનવાય ખાતેની યુએસડીએ જીનબેંક છે.
2005 માં 14 દેશો વચ્ચે બહુરાષ્ટ્રીય પ્રયાસ તરીકે ટમેટા જીનોમનું અનુક્રમ શરૂ કરવામાં આવ્યું હતું અને 2012 માં પૂર્ણ થયું હતું. મોટા પ્રમાણમાં આનુવંશિક અને ફેનોટીપિક ડેટાનું વિશ્લેષણ કરવા માટે આર્ટિફિશિયલ ઇન્ટેલિજન્સ, મશીન લર્નિંગ અને અદ્યતન અલ્ગોરિધમ્સના ઉપયોગથી આ પ્રયાસોને મોટા પ્રમાણમાં વેગ મળ્યો છે.
ટામેટા પાન-જીનોમ
2020 માં બોયસ થોમ્પસન સંસ્થાના સંશોધકોએ વધુ સંપૂર્ણ અને ઉપયોગી ટમેટા પાન-જીનોમ બનાવવા માટે જંગલી ટામેટાં માટે ઉચ્ચ-ગુણવત્તાનો સંદર્ભ જીનોમ બનાવ્યો. તેઓએ જીનોમના વિભાગો શોધી કાઢ્યા જે ફળોના સ્વાદ, કદ અને પાકવા, તાણ સહનશીલતા અને રોગ પ્રતિકારકતા ધરાવે છે. ડીએનએના ખૂબ લાંબા ટુકડાઓ વાંચી શકે તેવી અદ્યતન સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીના ભાગરૂપે આભાર, સંદર્ભ જીનોમ હાલના ડેટાબેઝ કરતાં વધુ સંપૂર્ણ અને સચોટ છે.
જૂની સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજીઓ જે ડીએનએના ટૂંકા ટુકડાઓ વાંચે છે તે સિંગલ-બેઝ લેવલ પર મ્યુટેશનને ઓળખે છે. જો કે, તેઓ ડીએનએના મોટા ભાગોના દાખલ, કાઢી નાખવા, વ્યુત્ક્રમો અથવા ડુપ્લિકેશન જેવા માળખાકીય પ્રકારો શોધવામાં સારા નથી.
2019 માં, સંશોધકોના એક આંતરરાષ્ટ્રીય જૂથે 725 ફાયલોજેનેટિકલી અને ભૌગોલિક રીતે પ્રતિનિધિ જાતોમાંથી જીનોમ સિક્વન્સનો ઉપયોગ કરીને ટમેટા પેન-જીનોમ બનાવ્યો. આ ડેટાબેઝમાં 4,873 જનીનોનો સમાવેશ થાય છે જે મૂળ સંદર્ભ જીનોમમાં મળ્યા નથી. વર્તમાન/ગેરહાજર ભિન્નતાના પૃથ્થકરણોએ ટામેટાંના પાળવા અને સુધારણા દરમિયાન નોંધપાત્ર જનીન નુકશાન અને જનીનો અને પ્રમોટરોની તીવ્ર નકારાત્મક પસંદગી જાહેર કરી.
www.seedworld.com પર સંપૂર્ણ લેખ વાંચો.